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  • 遺伝子編集技術はどのように進化しているのでしょうか?

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    遺伝子編集技術はどのように進化しているのでしょうか?

    31年前の1993年、アリカンテ大学のスペインの微生物学者フランシス・モヒカは、サンタポーラ塩原で発見されたいくつかの古細菌(バクテリアに似た原核微生物)のゲノム中に短いDNA配列の奇妙な繰り返しを発見し、この観察結果を発表した。 。彼はそれらを最初に見たわけではなく、日本とオランダの微生物学者は以前に他の細菌でそれらを観察していましたが、それらを調査し、それらを説明し、富をもたらした英語の頭字語であるCRISPRと名付けることを最初に決めたのは彼でした。今日、すべての研究者の口に上がっています。 10 年後、彼は新たな瞬間を迎えました。そして、これらの反復配列のグループには、細菌に感染するウイルスに対する防御機能があるに違いないと提案しました。これらの発見を出版物に記載するのにさらに 2 年かかりました。当初は、細菌が Mojica が提案したような遺伝に基づく免疫システムを持っていると信じていた人は誰もいなかったためです。そして彼は正しかった。この先駆的な出版物は、エマニュエル・シャルパンティエとジェニファー・ダウドナという二人の研究者によって読まれ、2012年に協力して、この細菌の防御システムを遺伝子編集ツール、すなわち、DNAを正確に切断できるヌクレアーゼ(Cas9)に変換することを提案した。小さなガイド RNA 分子。このアイデアにより、8 年後、この 2 人の研究者はノーベル化学賞を受賞しました。それ以来、これらのツールにはさまざまなバージョンが登場し、生物学、バイオテクノロジー、生物医学への応用は成長と蓄積を止めていません。

    CRISPRの始まり

    CRISPR-Cas9 として知られるこれらの遺伝子編集ツールの最初のバージョンは、2013 年初めに研究者のフェン・チャン氏とジョージ・チャーチ氏が率いる北米の 2 つの研究所によって検証されました。これらのツールを使用すると、あらゆる生物のあらゆるゲノムの DNA を切断できます。特定のシーケンスで非常に正確に生きています。 DNA二重らせんのこれらの切断は細胞自体によって修復される必要があり、ゲノムのこれらの傷の修復中に、通常、切断された遺伝子の不活性化につながる突然変異が発生し、治療効果や/またはバイオテクノロジー、このプロセスに基づくさまざまな遺伝子治療。鎌状赤血球などの重篤で不治の血液疾患を治療するために、まず英国、次に米国、そして最終的に欧州連合で最初に承認されたCRISPRに基づく遺伝子治療であるカスゲビーを強調する必要がある。細胞貧血またはベータサラセミア。

    新しい特性を持ち、作物によりよく適応したり、より大きな利益をもたらしたりする、遺伝子編集された植物における現在の応用の多くは、これらの第一世代の CRISPR ツールの使用に基づいています。ヨーロッパでは、これらの進歩は、新しい植物品種の開発におけるこれらの新しい戦略の使用を妨げる、更新が保留されている時代遅れの法律によって罰せられています。ヨーロッパ以外のほとんどの国は、これらの慣行をあたかも遺伝子組み換え植物であるかのように規制しないことを選択していますが、これは欧州連合でも実際に起こっており、ヨーロッパ外とヨーロッパ内で起こっている進歩の間に新たな断絶と競争力の喪失を生み出しています。希望はすぐに解決されるでしょう。

    遺伝子編集技術はどのように進化しているのでしょうか?
    フランシス・モヒカは、いくつかの古細菌のゲノム中に短い DNA 配列の奇妙な繰り返しを発見しました。出典: iStock / DrAfter123

    切断面の左右の領域をカバーする小さな DNA 配列を提供することによって切断面の修復を促進することもでき、偶然にも配列を自由に導入できるため、新しい遺伝子治療戦略の可能性が開かれます。しかし、この戦略は研究室ですぐに検証されましたが、効率が限られていることと、細胞が活発に分裂するように修正する必要があることの両方により、残念ながら臨床的意義はほとんどありませんでした。そして、私たちの体内には、ニューロンなど、通常は分裂しない細胞がたくさんあります。

    二代目

    第一世代の CRISPR ツールの限界は、ボストンの BROAD Institute の研究者David Liuの才能のおかげで、ベース エディターと呼ばれる第 2 世代の編集タンパク質の設計によって大幅に克服されました。基本的に、この第 2 世代の CRISPR ツールを使用すると、DNA を切断することなく、したがって第 1 世代のツールの制限を受けることなく、ゲノム内の文字を化学的に非常に正確に変更することができます。基本エディターの 3 つのバージョンが報告されています。A を G に変換するもの、C を T に変換するもの、および C を G に変換する 3 番目のバージョンです。これらの基本エディターはすでに使用されており、正常に動作しています。は、血中コレステロールの低下を引き起こす特定の遺伝子を不活性化することによって、T細胞急性リンパ芽球性白血病などの一部の血液がんを治療したり、血中コレステロール値が高い人々を治療したりする臨床試験で使用されています。

    多作の研究者であり発明家である David Liu は、高品質エディターとして知られる第 3 世代の CRISPR ツールも開発しました。これは、これまでに知られている中で最高のものです。この場合、まだ臨床試験でテストされていないこれらのツールは、すべての利点を提供し、以前の CRISPR ツールの制限のほとんどを解決し、遺伝子編集アプリケーションの開発にとって大きな希望となります。

    現在、主に血液に関係するさまざまな疾患に対する遺伝子治療の実験的開発を検証する臨床試験がすでに100件以上行われているが、進行性視力喪失(レーベル先天性黒内障)やそのような深刻な希少疾患を対象としたものもある。トランスサイレチンアミロイドーシスまたは先天性血管浮腫など。これらの治験のほとんどは患者の体外で介入を実施し、最初に血液から幹細胞を取得し、研究室で編集してから同じ患者に戻します。これはいわゆる「生体外」戦略です。患者が治療として CRISPR-Cas9 ツールを直接受け取る「生体内」アプリケーションも開発され始めています。

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    さまざまな疾患に対する遺伝子治療の実験的開発を検証する臨床試験がすでに 100 件以上行われています。出典: iStock / koto_feja

    CRISPR: 理論から実践へ

    CRISPR-Cas9ツールを患者に導入するには、毒性遺伝子を取り除いたウイルスをトランスポーター、または専門的には脂質ナノ粒子と呼ばれる脂肪滴として使用することができ、これは両社が開発した新型コロナウイルス感染症ワクチンの投与に使用されるものと同じである。 SARS-CoV-2 コロナウイルスによって引き起こされたパンデミックから私たちを救ってくれたモデルナとファイザー-BioNTech。

    CRISPR-Cas9 変異体も開発されており、これは DNA を切断することで機能するのではなく、これらのタンパク質がゲノム内の特定の場所、たとえば特定の遺伝子の近くに特異的に配置され、活性化因子または抑制因子を運ぶことができる能力を利用して機能します。そこでの遺伝子の発現、エピジェネティック編集と呼ばれます。これらの戦略は、DNA の一方または両方の鎖を切断する必要がある以前の戦略よりも安全であると考えられています。

    スペインでは、数十年、数百年、あるいは数十億年前に存在していたはずの細菌に由来する新しい CRISPR システムが入手されました。これらの古代のツールは、現在使用されている CRISPR ツールによって課せられた制限を克服すると期待されています。CRISPR ツールは、人間に感染を引き起こす病原性細菌に由来しており、私たちの免疫システムはすでにそれらに対する抗体を持っています。

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    ウイルスを使用して、CRISPR-Cas9 ツールを患者に導入することができます。出典: iStock / koto_feja

    CRISPR は今や医療の現実となっています

    CRISPR 遺伝子編集ツールに基づく最初の治療法はすでに患者に届けられているが、キャスゲビーの場合は 220 万米ドルという異常な治療費がかかるため、重要な制限がある。これは確かに、生物医学に専念する私たちが現在解決しなければならない倫理的、社会的、経済的課題です。すでに存在する治療法とその成果が、治療費を支払う余裕のある患者だけでなく、それを必要とするすべての患者に確実に提供できるようにする。そのためには、製薬企業やバイオテクノロジー企業が医薬品の開発への投資に対して国民医療制度が想定できる合理的な価格で補償されるという正当な権利を両立させなければなりません。

    最近、カリフォルニア州パロアルトの研究所の研究者らは、ISと呼ばれる細菌の小さな可動要素に基づく新しい遺伝子編集ツールを提案した。トランスポゾンは、ゲノムの異なる部分の間を飛び越え、どこからどこまでを制御できる。彼らはジャンプします。彼らは、出発点となる配列と目的地となる DNA 配列という 2 つの命令を含む小さな RNA 分子のおかげでジャンプの制御を実現します。

    「ブリッジエディション」と呼ばれるこの最新の新しいツールの成功を判断するのはまだ時期尚早ですが、明らかなことは、何十億年もの間地球上に存在してきた細菌には、切断するための数多くの戦略を開発する時間があったということです。そして、核酸、DNA、RNAを複数の方法で修飾することですが、これについては私たちは研究し、理解し始めたばかりです。

    Lluis Montoliuは、国立バイオテクノロジーセンター(CNB) の CSIC 研究者です。

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  • なぜ自然の衛星には環がないのでしょうか?

    土星の輪が綺麗ですね。そして、それらは私たちの太陽系にある最も有名な惑星環です。あまり知られていませんが、木星、天王星、海王星にも環があります (図 1-2)。そして、これらの惑星の衛星にはたくさんの衛星があり、中にはかなり大きな衛星もあるのに、なぜどの衛星にも輪がないのでしょうか?

    リングは非常に薄い構造で、わずか数キロメートルから、非常に広範囲にわたる数千キロメートルにも及びます。地球上のサッカー場 1 つまたはいくつかの大きさの紙のようなもので、そのサッカー場の中心にある中心円と同じ大きさの球体になります。

    リングの構成

    指輪は何でできていて、どのように形成されるのでしょうか?土星の環は、カッシーニ探査機など、土星に到達した探査機で撮影されています。観察から、惑星のすべての環は、非常にさまざまなサイズの氷と岩の破片で構成されていることが推測できます。数十メートルの岩石・氷の破片からマイクロメートルサイズの粒まであります。この物質は、惑星に非常に近づくと潮汐力によってばらばらになる、より大きな天体の崩壊から生じます。前述したように、この物質はいったん分解すると、惑星の赤道面の非常に限られた領域を周回したままになり、粒子は互いに衝突し続けます。

    さて、自然の衛星である衛星も輪を生成する可能性があり、それらが非常に近づくと、何らかの物体が崩壊する可能性があります。それでは、その物質はすべて衛星の周りの軌道上に残るのでしょうか、それとも中心惑星に捕らえられるのでしょうか?それとも衛星自体に落ちてしまうのでしょうか?

    なぜ自然の衛星には環がないのでしょうか?
    図 1. 天王星の環。出典: JWST。
    なぜ自然の衛星には環がないのでしょうか?
    図 2. 海王星の環。出典: JWST。

    山と月

    土星の衛星であるレアとイアペトゥスでは、赤道の周りの山脈のように見えるものが写真に撮られており、大量の物質が同じ領域に落ちて山を形成しているように見えます(図3)。これらの赤道山脈は、過去にレアとイアペトゥスの両方に赤道の周りを周回する環、または少なくとも物質が存在し、それが時間の経過とともに堆積したことを証明するものとなるでしょう。

    なぜ自然の衛星には環がないのでしょうか?
    図 3. 衛星イアペトゥスの赤道山

    それで終わりですか?環を持つことができるのは惑星だけですか?そしてなぜ水星、金星、地球、火星のような内惑星には輪がないのでしょうか?そうですね、地球や火星にも過去に何らかの環があったという証拠があります。私たちの惑星では、一連の 21 個の整列したクレーターの証拠が発見されており、これらは地球の周りに一時的に赤道リングを形成したであろう物質の落下によって生じた可能性があることを示唆しています。 4,000万年の期間にわたって、衝突の頻度の増加が観察されています。この結論に達するために使用された方法は非常に興味深いです。地球にはプレートの動きが存在するため、現在の大陸の形状は数百万年前の地球の形状とは異なります。そこで、数百万年前の大陸の様子をコンピューターでシミュレーションしました。ある時、赤道直上にクレーターが並んでいるのが発見される。ちょうどその時期に存在するL型隕石物質が増加していることなど、さらなる証拠があります。つまり、数百万年前、地球の赤道を周回する物質があり、それが落下してクレーターを残し、その後大陸とともに移動したということです。

    いくつかの発見の好奇心旺盛な性質と、いくつかのアイデアの革新的な性質のもう一つの証拠。

    地球の環からの物質の起源

    この物質の起源は、瓦礫の山である瓦礫の山型小惑星であり、地球近くを通過する際に崩壊して環を形成したものと考えられる。これはリングを形成する方法を強化します。小さな天体が大きな天体に近づきすぎると、物質は最終的に落下するか、衛星ではなく大きな天体の周りにリングを形成することになります。瓦礫の山型の物体というこのアイデアは非常に新しく、約 30 年前にはこの概念は存在しなかったため、より大きな天体の近くを通過するときに崩壊する物体を考えることはさらに困難でした。

    しかし、環は惑星の周りにのみ形成されるのでしょうか?という疑問が生じます。いや、私たちの太陽系にはさらに驚くべきことがたくさんあります。ここ 10 年間の驚きは、かなり大きな小惑星の周りにも環があることです。 2013年、私はグラナダにあるCSICアンダルシア天体物理学研究所の研究グループとともに、ケンタウロス型天体であるカリクロによる恒星食を観測するキャンペーンに参加した。ケンタウロスは土星を超えて太陽の周りを回る天体です。カリクロは大きさ約200kmの天体です。カリクロが星の前を通過する際に星の明るさを測定したところ、小惑星に隠れる直前と直後に明るさが急激に減少するのを見て目を見張りました(図4)。この掩蔽技術は、天王星と海王星の環の発見にすでに使用されていました。現在、カリクロのような惑星ではないさらに多くの天体の周囲にリングが検出されています。別のケンタウルス型天体であるキロン、および太陽系外縁天体であるハウメアとクアオアールがリストの次に挙げられます。そして、もっとリングを見つけられることを願っています。

    なぜ自然の衛星には環がないのでしょうか?
    カリクロによる星の掩蔽の光曲線。中心天体による掩蔽の前後で、急速かつ対称的な 2 つの明るさの低下が確認できます。

    もしかして、指輪は短期間しか持続しない構造物なのでしょうか?そして、私が短い時間と言っているのは、地質学的時間、つまり数百万年であり、現在はそのような時間は見られません。太陽系の最大の衛星を周回する粒子の持続時間を分析した研究があり、 SIリングが存在する可能性があり、数百万年続く可能性があるという結論に達しています。

    太陽系に小惑星がより多く存在し、より「汚れていた」過去には、月の周りの輪がより一般的だったのでしょうか?おそらく、私たちは月輪の見え方に関しては不運の時期にあるのかもしれません。

    もし私たちの月に輪があったとしたら、過去の物語や詩、歌の歌詞はどのようなものになっていたでしょうか?地球から見る景色はきっと美しいものでしょう。

    René Duffard は、アンダルシア天体物理学研究所の CSIC 研究者です。

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  • 人工知能は個別化医療にどのような影響を与えるのでしょうか?

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    人工知能は個別化医療にどのような影響を与えるのでしょうか?

    がんの診断を受けたとき、予期せぬ副作用を伴う一般的な治療に直面する代わりに、医師があなたの遺伝子プロファイル、腫瘍のプロファイル、生活条件に合わせて特別に設計された個別化された治療法を提案すると想像してみてください。これは SF のように聞こえるかもしれませんが、人工知能のおかげですでに現実になり始めています。

    個別化医療は病気の治療法に革命をもたらしており、人工知能 (AI) がこの変化を加速させています。病気の予測から各患者に合わせた治療の設計まで、AI はより正確でアクセスしやすい医療を可能にします。この記事では、このテクノロジーがどのように医療を再構築し、驚くべき方法で患者の生活の質を向上させているかを探ります。

    医療における人工知能: それはどのような扉を開きますか?

    個別化医療は、各個人はユニークであるため、遺伝的、環境的、ライフスタイルの特性に合わせた治療が必要であるという考えに基づいています。この分野での AI の応用は、この哲学の自然な拡張であり、大量のデータを分析する機械学習アルゴリズムの機能は、人間では見つけることが不可能なパターンや相関関係を特定するのに役立ちます。

    個別化医療における AI のハイライトの 1 つは、遺伝データを処理および処理できる機能です。標準的な検査や一般的な診断に頼るのではなく、各患者の遺伝子プロファイルを考慮したより詳細な分析にアクセスすることが可能です。このデータを電子医療記録、医療画像、ライフスタイル データなどの他の情報源と組み合わせることで、 AI システムは特定の治療に対する患者の反応を正確に予測できます。少なくともそれが私たちが達成したいことです。

    人工知能は個別化医療にどのような影響を与えるのでしょうか?
    個別化医療は、個人はそれぞれユニークであるという考えに基づいています。出典: Midjourney / Eugenio Fdz.

    より速く、より正確で、よりアクセスしやすい医薬品

    より具体的な例で説明すると、腫瘍学的治療の場合、 AI モデルは腫瘍の遺伝子を分析し、この情報を腫瘍細胞で生成されるタンパク質の情報と組み合わせることができます。この個別化されたアプローチは、患者の特性に合わせて特別に調整されたオプションが選択されるため、治療の成功率を向上させ、治療の副作用を軽減する可能性があります。

    人工知能による個別化医療におけるもう 1 つの進歩は、医療診断の改善です。 AI システムは大量のデータを数秒で分析できるため、診断プロセスが大幅に高速化されます。これは、AI アルゴリズムが X 線、CT スキャン、MRI などの画像を検査して、人間の放射線科医が気付かない可能性のある微妙なパターンを検出できる放射線医学などの分野で特に価値があります。

    たとえば、一部の AI アルゴリズムは、乳がん、黒色腫、心血管疾患などの病気の検出において、医師と同等またはそれを上回る精度をすでに実証しています。これらのシステムは腫瘍や異常を特定するだけでなく、病気の段階の決定にも役立ち、より個別化された治療計画を可能にします。

    AI はスピードと正確さに加えて、医療診断へのアクセスも民主化しています。人工知能に基づくツールは、資源が乏しい環境でも使用でき、農村部の人口や医療専門家が限られている発展途上国での病気の早期発見に役立ちます。 AI は診断プロセスの一部を自動化することでコストを削減し、より多くの人が医療サービスを利用できるようになります。

    人工知能は個別化医療にどのような影響を与えるのでしょうか?
    一部の AI アルゴリズムは、すでに驚くべき精度を実証しています。出典: Midjourney / Eugenio Fdz.

    AIと創薬

    人工知能のおかげで革命が起きているもう 1 つの分野は、新薬の開発です。これらのモデルにより、治療標的 (病気の治療に役立つ薬剤の標的となるタンパク質や細胞などの体の特定の部分) を発見するプロセスを加速することが可能になります。従来、これらの標的を特定し、疾患におけるその役割を理解することは、時間と費用がかかるプロセスでした。ただし、 AI は大量の遺伝データ、分子データ、臨床データを分析して、特定の疾患にとってこれらの部分のどれが最も重要かを予測できます。

    人工知能が生物医学をどのように変革しているかを示す重要な例は、タンパク質構造を予測する DeepMind ツールAlphaFoldですタンパク質がどのように折りたたまれるかを知ることで、その機能や他の分子との相互作用を理解することができ、これは医薬品をより効率的に設計するために重要です。具体的な例としては、マラリア原虫の繁殖に関連するタンパク質の構造の発見が挙げられます。このタンパク質は、雄性配偶子と雌性配偶子の融合を可能にする役割を担っています。この知識により、その繁殖を阻止し、その蔓延を阻止できるワクチン開発のターゲットとなる可能性のあるものを特定することが可能になります。

    AlphaFold は、新薬の発見を加速することに加えて、抗生物質耐性やプラスチック廃棄物管理などの分野でもすでに貢献しています。これらすべての成果により、 AlphaFold は今年のノーベル化学賞を受賞しました。

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    生殖母細胞表面抗原 48/45 タンパク質に関する AlphaFold の結果は、潜在的なマラリア ワクチンの開発に使用されています。出典: ディープマインド

    医療 AI における人間の役割とインフラストラクチャの課題

    アルゴリズムは正確な推奨事項を提供できますが、結果を解釈し、情報に基づいた意思決定を行うプロセスに臨床医が関与する必要は依然としてあります。患者の治療における感情的、心理的、文脈的な側面は機械では完全には理解できないため、医療における人間の相互作用は依然として基本的なものです。

    もう 1 つの重要な課題は、これらのテクノロジーを医療システムに統合するための適切なインフラストラクチャの必要性です。人工知能が個別化医療の重要な部分になるにつれ、病院や医療センターはインフラストラクチャを更新し、これらのツールを効果的に使用できるように医療専門家を訓練する必要があります。ただし、このプロセスはゆっくりと進むため、ビジョンと知識を備えた人材が変化を主導し推進する必要があります。未来の医療のために AI がもたらす利点を最大限に活用できるかどうかは、私たちの手にかかっています。

    Lara Lloret は、カンタブリア物理学研究所 (UC-CSIC)の CSIC 研究者です。

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